RNA-seq con DESeq2: del diseño al informe

Libro práctico de 110 páginas

Análisis diferencial de RNA-seq en serio. Diseños multi-factor, batch effects, pipelines con targets, integración con Quarto y un informe corporativo final reproducible.
Autor/a

Rmori

Nota

Próximo lanzamiento, septiembre 2027. Esta página es el stub del producto. Sample chapter, índice completo y enlace de compra se publicarán al cerrar la edición.

Para quién es este libro

Si has hecho la ruta gratuita “RNA-seq con Bioconductor” y trabajas con datos reales, diseños multi-factor, batches mal balanceados, decisiones que se tienen que defender, este libro es la siguiente etapa.

Qué incluye

  • 110 páginas de contenido editorial (PDF).
  • Tres casos reales seguidos de principio a fin: caso-control, time-course y multi-factor con interacción.
  • Diseños no balanceados y rescate con sva / RUVSeq.
  • Pipelines reproducibles con targets y renv.
  • Informe final con Quarto: figuras, tablas, métodos y sessionInfo.
  • Datasets, scripts y proyecto completo descargables.
  • Actualizaciones de la edición vigente incluidas.

Índice (provisional)

  1. Antes del análisis: diseño y power
  2. Importación moderna con tximeta
  3. Diseños multi-factor: interacciones y contrastes
  4. Batch effects: cuándo ~ batch + condicion, cuándo sva
  5. Shrinkage en serio: apeglm, ashr, comparaciones
  6. QC visual y diagnóstico de modelo
  7. Anotación + enriquecimiento funcional avanzado
  8. Pipelines con targets y renv
  9. Informe final con Quarto + plantilla corporativa
  10. Tres casos completos

Precio y compra

Precio: 29 €. Enlace de compra disponible al lanzamiento.